Univerzitet u Sarajevu je velika i složena organizacija u čijoj misiji je da kroz nastavu i istraživanje educira kvalitetne, sposobne, kreativne i međunarodno kompetentne kadrove u svim oblastima od interesa za Bosnu i Hercegovinu
Kadrove koji će profesionalno i kvalitetno izvršavati zahtjevne zadatke moderne privrede u evropskom i svjetskom političkom, ekonomskom, društvenom i kulturološkom okruženju.
Opredjeljenje Univerziteta je da bude autonomna akademska zajednica nastavnika-istraživača, umjetnika i studenata, inkorporirana u međunarodnu univerzitetsku i akademsku zajednicu.
Univerzitet u Sarajevu nastoji kontinuirano jačati svoju ulogu odgovorne institucije unutar društvene zajednice u kojoj djeluje, te osigurati ulogu prepoznatljivog središta naučnog i umjetničkog rada, koje okuplja timove domaćih i međunarodnih stručnjaka i umjetnika oko projekata relevantnih u domaćem, regionalnom, te širem društvenom kontekstu i okruženju.
Organizacija i djelatnost Univerziteta u Sarajevu, kao javne visokoškolske ustanove u Kantonu Sarajevo, propisani su Okvirnim zakonom o visokom obrazovanju BiH, Zakonom o visokom obrazovanju Kantona Sarajevo i Statutom Univerziteta.
Univerzitet u Sarajevu čini dvadeset i pet fakulteta i akademija i pet instituta, punopravnih članica Univerziteta, interno organiziranih unutar šest vijeća grupacija nauka/umjetnosti iz područja:
- društvenih nauka
- humanističkih nauka
- medicinskih nauka
- prirodno-matematičkih i biotehničkih nauka
- tehničkih nauka
- umjetnosti.
Punopravne članice Univerziteta u Sarajevu su:
- Akademija likovnih umjetnosti
- Akademija scenskih umjetnosti
- Arhitektonski fakultet
- Ekonomski fakultet
- Elektrotehnički fakultet
- Fakultet islamskih nauka
- Fakultet za kriminalistiku, kriminologiju i sigurnosne studije
- Fakultet političkih nauka
- Fakultet sporta i tjelesnog odgoja
- Fakultet za saobraćaj i komunikacije
- Fakultet zdravstvenih studija
- Farmaceutski fakultet
- Filozofski fakultet
- Građevinski fakultet
- Katolički bogoslovni fakultet
- Mašinski fakultet
- Medicinski fakultet
- Muzička akademija
- Pedagoški fakultet
- Poljoprivredno-prehrambeni fakultet
- Pravni fakultet
- Prirodno-matematički fakultet
- Stomatološki fakultet sa klinikama
- Šumarski fakultet
- Veterinarski fakultet
- Institut za historiju
- Orijentalni institut
- Institut za jezik
- Institut za genetičko inženjerstvo i biotehnologiju
- Institut za istraživanje zločina protiv čovječnosti i međunarodnog prava
Pridružena članica Univerziteta u Sarajevu je Fakultet za upravu.